[新型冠状病毒BA]基因组序列发布

产品质量评估结果:对字符串完备德博瓦桑县Complete的基因字符串,在5个各方面展开产品质量检验,主要包括未明核苷酸(N)数量、微扰核苷酸(非ATGCN的核苷酸)数量、与参照字符串(MN908947)对照后再次出现的gap(deletion、insertion、indel)数量、突变数量、突变表面积(突变数/区段宽度,区段宽度<=20nt)。突变数量为字符串全长约范围内的大部份突变,余下产品质量评估结果词条只考量蛋白质代码地区。

如前所述表单中列举的前提展开产品质量评估结果,绿色生态则表示透过质量控制检验,黄色提示重要信息没透过质量控制检验。将滑鼠置放在每一绿色生态/黄色格子下面将展现数量等重要信息,详细情况见表单中的展现文本。

暗含黄色格子的字符串风险较大采用。N和微扰核苷酸数量过多,和参照字符串对照再次出现数处gaps,那些情况提示重要信息可能将由于低叶黄杨、低定序广度、控制技术问题等导致字符串产品质量相对较低。与此同时,高突变数和高突变表面积提示重要信息可能将存有极度,使用者采用那些字符串时有必要性更进一步自查。

假如字符串所含非常多未明核苷酸或微扰核苷酸,无须展开突变有关的产品质量评估结果。与此同时,那些行为源病原体株的字符串相对于参照字符串突变非常多,不展开突变有关的产品质量评估结果,仅提供更多对未明核苷酸数和微扰核苷酸数的评估结果。

浏览表单中产品质量评估结果两列展现任一产品质量检验词条相关联的数量。突变表面积为YES/NO,则表示有/无突变密集度。假如没展开突变检验,表明为NA。

市场预期突变核苷酸数量依照每月每一核苷酸错误率8.69 × 10?4 排序,详细资料请参照该文Liu et al., 2020

发布于 2022-09-22 23:09:55
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